Jest kilka metod, których można użyć do czyszczenia aparatu. Można to robić za pomocą oddzielnej, przeznaczonej tylko do tego szczoteczki i pasty do zębów, można tez używać szczotki do protez i szarego mydła. Od czasu do czasu (raz na 2 tygodnie) można aparat wrzucić do szklanki z tabletką musująca do czyszczenia protez dostępną w aptece, lub do wody z łyżeczką sody oczyszczonej i octu – uwaga – będzie się pienić.
Po czyszczeniu aparat należy wytrzeć do sucha i pozostawić w przeznaczonym do tego, wentylowanym pudełku.